Lohta fileoitaessa nahkaa ei oteta pois. Lohta ei myöskään tarvitse suomustaa, koska suomut pehmenevät syötäviksi kypsentämisen aikana. Leikkaamalla lohta poikkisuuntaan saadaan mm. lohikyljyksiä ja perhosleikkeitä eli lohimedaljonkeja. Kyljys on valmis sellaisenaan ja perhosleikkeen
saa leikkaamalla fileestä 4-5 cm:n pituisen palan ja tämän jälkeen puolittaa sen vielä veitsellä nahkaan saakka ja lopuksi taittaa puolikkaiden nahkapuolet vastakkain.
Lohen kuten muidenkin lohikalojen fileissä on kylkiruotojen lisäksi ruokailua haittaavia pystyruotoja. Ruodot sijaitsevat kylkiviivassa fileen etuosan paksuimmassa kohdassa. Ruotoja on kaikkiaan yli kaksikymmentä kappaletta. Selkäevän jälkeen näitä pystyssä olevia lihasruotoja ei enää ole.
Lihasruodot on helppo nyppiä pois jo raa'asta kalasta. Samalla esimerkiksi graavilohen leikkaaminen helpottuu. Ruotojen nyppimiseen kannattaa käyttää tasareunaisia pinsettejä tai isoissa fileissä pihtejä. Ruodot kannattaa vetäistä vinosuuntaan, jolloin kalan liha ei repeydy.